逃兵机制是影响战局的重要因素之一。游戏高度还原了历史中各国对逃兵的处置方式，玩家需要了解这些规则才能更好地管理军队并维持士气。逃兵在游戏中不仅会削弱战斗力，还可能引发连锁反应，导致防线崩溃或任务失败。合理应对逃兵问题是玩家必须掌握的战术之一。
游戏中的逃兵主要分为两种类型：普通士兵因士气低落或战斗压力过大而逃亡，以及法西斯阵营特有的败兵单位。前者会直接减少部队人数，后者则可能转化为游离在战场后方的敌对单位，骚扰玩家的资源点和补给线。针对普通逃兵，玩家可以通过提升士气、合理分配补给和避免连续作战来降低逃亡概率。而对于法西斯败兵，则需要建立哨所或派遣快速反应部队进行清剿，防止其破坏后方秩序。
不同阵营对逃兵的处理方式也有所区别。盟军和轴心国在游戏中的惩罚机制参考了历史设定。苏联阵营的逃兵会被编入惩戒营，执行高危险任务，若幸存则有机会回归原部队。德国阵营的逃兵则可能被强制派遣进行扫雷等自杀式行动。美国阵营的处置相对宽松，逃兵通常会被送上军事法庭，根据情节轻重判处禁闭或开除军籍。这些差异要求玩家根据所选阵营调整管理策略，以避免因逃兵问题影响整体作战计划。
玩家可以派遣宪兵队或特种部队搜捕逃兵，成功抓捕后能选择将其重新编入部队或施加惩罚以警示他人。这一机制增加了策略深度，玩家需权衡资源消耗与军队稳定性。逃兵数量过多会触发特殊事件，如士气崩溃或友军叛变，进一步加大游戏难度。保持纪律和合理轮换部队是避免恶性循环的关键。
二战风云通过逃兵机制模拟了真实战争中纪律与士气的平衡问题。玩家需综合运用后勤管理、战术部署和阵营特性来最小化逃兵影响。忽视这一问题可能导致战局逐渐失控，而妥善处理则能提升军队的持久战斗力。游戏的设计鼓励玩家在追求战略目标的同时，也要关注士兵的心理状态和战场环境，从而更全面地体验二战指挥官的决策挑战。
